Добавить новость
123ru.net временно располагается в домене ru24.net

Октябрь 2012
Ноябрь 2012
Декабрь 2012
Январь 2013
Февраль 2013
Март 2013
Апрель 2013
Май 2013
Июнь 2013
Июль 2013
Август 2013
Сентябрь 2013
Октябрь 2013
Ноябрь 2013
Декабрь 2013
Январь 2014
Февраль 2014
Март 2014
Апрель 2014
Май 2014
Июнь 2014
Июль 2014
Август 2014
Сентябрь 2014
Октябрь 2014
Ноябрь 2014
Декабрь 2014Январь 2015Февраль 2015Март 2015Апрель 2015Май 2015Июнь 2015Июль 2015
Август 2015
Сентябрь 2015
Октябрь 2015
Ноябрь 2015
Декабрь 2015
Январь 2016
Февраль 2016Март 2016Апрель 2016Май 2016Июнь 2016Июль 2016Август 2016
Сентябрь 2016
Октябрь 2016Ноябрь 2016Декабрь 2016Январь 2017Февраль 2017
Март 2017
Апрель 2017
Май 2017
Июнь 2017
Июль 2017
Август 2017
Сентябрь 2017
Октябрь 2017
Ноябрь 2017
Декабрь 2017
Январь 2018
Февраль 2018
Март 2018
Апрель 2018Май 2018
Июнь 2018
Июль 2018
Август 2018
Сентябрь 2018
Октябрь 2018
Ноябрь 2018
Декабрь 2018
Январь 2019
Февраль 2019
Март 2019
Апрель 2019
Май 2019
Июнь 2019
Июль 2019Август 2019Сентябрь 2019Октябрь 2019Ноябрь 2019Декабрь 2019Январь 2020Февраль 2020Март 2020Апрель 2020Май 2020Июнь 2020Июль 2020Август 2020Сентябрь 2020
12345678910111213141516171819
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
Жизнь |

Microsoft Excel вынудил ученых переименовать гены

The Verge

Комитет HGNC (HUGO Gene Nomenclature Committee) выпустил обновленное руководство по наименованию человеческих генов. Среди прочего организация сообщает об изменении названий ряда генов, некорректно обрабатываемых программой Microsoft Excel. Эта программа по обработке табличных данных по умолчанию конвертирует названия вроде MARCH1 в даты, так что во избежание ошибок ученым пришлось их модифицировать.

Имена генам даются в соответствии с номенклатурными требованиями, разработанными HGNC — комитетом, ответственным за корректные названия генов человека. Среди общих принципов — имя должно даваться на английском, быть коротким и содержать информацию о функции или структуре продукта. Кроме полного имени гену дают аббревиатуру, по которой его можно быстро найти, например TNF для Tumor Necrosis Factor. Сокращение должно состоять только из заглавных букв латинского алфавита и арабских цифр, быть уникальным внутри генома и не иметь негативной окраски. Помимо этого рекомендовано вообще избегать сокращений, совпадающих генетическими терминами. Так, сократить название гена до CHR5 будет очень плохой идеей, — оно будет постоянно путаться с пятой хромосомой. Поиск генов с названиями вроде LOVE или SUN тоже проблематичен, поэтому имена совпадающие с распространенными словами тоже не рекомендованы.

Помимо новых рекомендаций в руководстве говорится о переименовании нескольких уже существующих генов. Среди попавших под раздачу — сокращения вроде DOPEY1 (одурманенный, тормозной, вялый от приема наркотиков), WARS и CARS (теперь WARS1 и CARS1) а заодно целая группа генов, которые переименовали из-за их некорректной обработки в Microsoft Excel. Сокращения вроде MARCH1 или SEPT1 программа по умолчанию конвертирует в даты, и связанные с этим ошибки регулярно всплывают в научных работах, — по оценке австралийских ученых они есть в каждой пятой статье, содержащей дополнительные exсel-таблицы с генами.

Excel — самая распространенная программа для обработки таблиц, и — хоть она заточена совсем не под работу с генетическими данными — ее регулярно для этого используют. При этом по умолчанию она конвертирует в даты все, что похоже на даты, и любой, кто не отключил эту опцию ручном режиме заранее для отдельных колонок получит на выходе некорректный список генов, при дальнейшей обработке которого тоже могут возникнуть трудности. Глобального решения этой проблемы Excel не предлагает и не планирует делать эти настройки более гибкими, так что ученым пришлось переименовывать гены. Теперь ген MARCH1 сокращен как MARCHF1, а SEPT1 как SEPTIN1, изменения коснулись и других аналогичных генов. Это первый случай, когда смена имени была обусловлена некорректной обработкой данных.

Правила наименования целых организмов не такие строгие, — они должны быть написаны латинскими буквами, подчиняться правилам латинской грамматики и быть биномиальными, но при этом первооткрыватель волен сделать их шутливыми, поэтичными или увековечить в них людей или персонажей. Так, у нас уже есть амеба-Гендальф, онихофора-Тоторо, червь-Обама и насекомое наездник Элбакян. В описании вида должна быть указана причина выбора названия, но в целом она может быть изложена в волном стиле.

Вера Мухина

Let's block ads! (Why?)

 

 

Читайте также

VIP |

«Кинотавр» назвал лауреатов фестиваля 2020 года

Мир |

Туроператоры: большинство зарубежных направлений не будут открыты до следующего лета, из-за чего начался бум раннего бронирования по России

Здоровье |

Малышева заявила, что средства с алоэ вызывают рак




Реальные статьи от реальных "живых" источников информации 24 часа в сутки с мгновенной публикацией сейчас — только на Лайф24.про и Ньюс-Лайф.про.



Разместить свою новость локально в любом городе по любой тематике (и даже, на любом языке мира) можно ежесекундно с мгновенной публикацией и самостоятельно — здесь.